Como ya dijimos, Faraday rechazó la teoría atómica de su época (en esto no era el único, pues dos científicos posteriores, el físico y filósofo de la ciencia Ernst Mach y el químico-físico Wilhelm Ostwald, ambos alemanes, también la rechazaron a finales del siglo XIX, cuando las pruebas de 1a existencia del átomo eran bastante concluyentes). Ello se debía a que Faraday consideraba a 1a materia como un continuo, de acuerdo con sus ideas de la acción electromagnética por contacto y no como una acción a distancia con vacíos intercalados entre corpúsculos ("Especulación tocante a la conducción eléctrica y a la naturaleza de la materia", 1844), llegando a admitir la existencia real de las líneas de fuerza que actuaban entre la materia que llenaba el espacio ("El carácter físico de las líneas de fuerza magnéticas", 1852) .
Durante estos años, Faraday realizó otros descubrimientos de menor importancia, como, por ejemplo, el rehielo y la obtención de oro rojo. E1 primero consiste en volver a formarse hielo después de licuarse, por efecto de la presión, y tiene importancia en la formación de bolas de nieve y en los glaciares, permitiendo a éstos moverse lentamente. En cuanto al "oro rojo", es un líquido con oro coloidal y se encuentra en vidrios de color rubí. Estas dos investigaciones fueron proseguidas con éxito por su sucesor como director de 1a Royal. Institution, el físico John TYNDALL (1820-1893).
En 1857 rehusó Faraday la presidencia de la Royal Society, pues, aparte de no sentirse con fuerzas para estar al frente de ella, ésta se había convertido más bien en una sociedad honorífica para las personas de cierto rango social, con lo que no estaba de acuerdo (durante los años que había pertenecido a ella apenas había asistido a sus reuniones). Su última investigación tiene fecha de 12 de marzo de 1862, es decir, cuando le faltaba poco para cumplir los setenta y un años; se trataba de la acción de un campo magnético sobre la refracción de la luz, no observando ningún efecto (con aparatos más adecuados, fue observado a finales de siglo por Zeeman). Unos años antes, en 1858, la reina Victoria, a petición de su ilustrado esposo, el príncipe Alberto, premió la labor de toda su vida donándole en Hampton Court, cerca de la residencia real, en las afueras de Londres, una confortable residencia para su vejez. En 1860 dio 1a última serie de conferencias para jóvenes, a las que había sido fiel toda su vida, pues para ellas instauró en la Royal. Institution sus muy populares "Christmas Juvenile Lectures" ("Conferencias de Navidad para jóvenes") - en una de estas conferencias, precisamente, dio una famosa sobre la combustión, que originó posteriormente el folleto titulado "The Chemical History of a Candle" ("Historia química de una bujía", 1862) -. También había establecido, desde 1826 y para los miembros de la citada institución, los "Friday Evening Disrcourses" ("Discursos de las tardes de los viernes"), muy apreciados porque en ellos se exponían las cuestiones científicas de reciente actualidad. En estas series de conferencias Faraday brilló a una gran altura como orador y experimentador, como lo atestiguaron asistentes a las mismas.
